"Исходный код" - программа, позволяющая вселяться в тело человека в последние восемь минут его жизни, чтобы с его помощью восстановить до мелочей все события этого промежутка времени. В пригородном поезде, следовавшем в Чикаго, террористы взорвали бомбу. Все пассажиры погибли. Правительству известно, что следующий взрыв будет еще мощнее. Капитана Колтера Стивенса с помощью программы воплощают в теле Шона Фентресса, ехавшего взорванным поездом. Задача Колтера - найти бомбу, вычислить террориста и способ детонации взрывного устройства. Помимо боевой задачи, у Стивенса появляется и личная мотивация. Дело в том, что оказавшись в теле Шона, он влюбился в свою попутчицу Кристину, и ему очень хочется, чтобы она осталась жива