В 2065 году Землю одолевают призракоподобные инопланетяне. Доктор Аки Росс, гениальный молодой учёный, пытается разгадать тайны инопланетян ради спасения не только Земли в целом, но и самой себя, так как её тело заражено частицами чужих. Она работает с элитным военным отрядом под командованием её старого друга Грея Эдвардса. Но пока Аки, ее руководитель доктор Сид и Грей работают над мирным разрешением проблемы, генерал Хейн замыслил уничтожить всех пришельцев одним ударом… даже если это приведёт к гибели Земли